布莱恩•芬奇被参议员莫拉救后注射了莫拉研究出的药剂因此对NZT免疫，随后他又揭发了亚当才是杀害伊莱的温斯顿的凶手，为自己洗清了冤屈。发现布莱恩对NZT免疫这让FBI丽贝卡的上司很感兴趣，希望可以通过研究布莱恩找到NZT的解药。但是丽贝卡提出让布莱恩进入FBI利用他的智慧资源帮助他们。FBI顺利解决了布莱恩父亲的肝源，以此为条件布莱恩答应进入FBI工作。

进入FBI以后，布莱恩受到监视和研究，他们想知道为什么布莱恩可以对NZT免疫，当然布莱恩不可能告诉他们。布莱恩的父亲手术顺利结束，布莱恩告诉家人自己马上就要和FBI合作。可是在FBI上班的第一天，他们只是让他服完NZT后待在房间里学习波斯语，这与布莱恩设想的完全不一样，令他十分失望。丽贝卡和同时鲍得一起去一名记者斯蒂芬。费舍车祸现场勘查。斯蒂芬。费舍是一名记者，因为揭露了很多丑闻，所以有很多上层人士很恨他。布莱恩希望一起去帮忙但是被拒绝。于是布莱恩上网收集了资料，发现这是谋杀同时找到了远程操控汽车的芯片，以及他设想的三种炸弹模型，他把这些告诉丽贝卡，但是丽贝卡只是赶着勘查就挂了电话，一个人待在无聊的房子里的布莱恩利用自己智慧再次顺利从FBI逃脱。

布莱恩去了赌场，利用自己的智慧赢了一大笔钱足够买他所需的材料。在公车上他教了一个父亲如何让自己的孩子在考试时发挥的更好，又劝回了一对即将分手的情侣，同时他也利用自己的材料组装好了他设想的三种炸弹模型。他到达车祸现场把模型交给丽贝卡。回到FBI后，丽贝卡的上司生气的斥责他的行为，告诉他如果再这么做就把他关到华盛顿的研究所，布莱恩只好答应。布莱恩去看望即将出院的爸爸，爸爸告诉他他妈妈和保险公司关于请护工的事而引起争执，并问布莱恩是否喜欢FBI这份工作。布莱恩回答说这是一个机会，他别无选择。

通过布莱恩的炸弹模型，鲍得基本把制作炸弹的嫌疑犯锁定为”金牛”.但是”金牛”似乎会隐身，他们花了一年的时间都没抓到。布莱恩通过上厕所的机会，利用读唇语知道了丽贝卡他们在找”金牛”。他上网搜寻了有关”金牛” 的资料，他发现”金牛”就是工程师达伦。卡伦。他把这件事告诉丽贝卡并告诉他们在达伦。卡伦的母亲名下有一个废弃汽车工厂，达伦。卡伦应该都是在那里制造炸弹的。

丽贝卡和鲍得找到达伦。卡伦的废弃汽车工厂，丽贝卡在工厂里发现了端倪，终于在保时捷汽车的前盖里发现炸弹零件。达伦。卡伦被逮捕了，他供出了经特建业的拉里。拉斯特仍特是背后出钱让他做炸弹炸死斯蒂芬。费舍的人。但是达伦。卡伦说斯蒂芬。费舍并不是因为他的炸弹而死。丽贝卡把这话告诉了布莱恩，斯蒂芬。费舍的车在还没触发炸弹芯片前就出事了。法医经过检查认为在事发前斯蒂芬。费舍就中风了，布莱恩不相信斯蒂芬。费舍才28岁怎么可能中风。丽贝卡安慰布莱恩通过达伦。卡伦的供述，FBI已经开始全范围的抓捕有出钱让达伦。卡伦做炸弹的人，这次他已经立了大功。布莱恩希望帮斯蒂芬。费舍这样一个帮助了很多人的人找到凶手，可是要如何人为地让人中风，他必须离开FBIO找到专家咨询。于是布莱恩利用声东击西再次成功逃脱，他找到专家咨询，又去了一趟和父亲发生纠纷的保险公司，在药效消失之前，他已经有了眉目。

丽贝卡回到家发现布莱恩正在家里等她。布莱恩告诉她自己的发现，他认为斯蒂芬。费舍绝对是被谋杀。因为他是成吉思汗的后裔，带有他的遗传标记，有人可以发明出一种病毒流感，让只要得这种流感的成吉思汗的后裔中风身亡。证据就是48小时内有两人也带有这种遗传标记的也因为中风身亡，而他们三个人联系就在于小莫莉咖啡店。丽贝卡的上司正和布莱恩说话，丽贝卡把她在小莫莉咖啡的发现告诉他们，有人通过喷雾传播病毒，目标是一名女子，而斯蒂芬。

费舍的咖啡碰巧在那所以也被感染病毒导致中风。布莱恩分析应该是有人要那名女子周围的一个人的命，但是那个人不好靠近，所以他利用这名女子传播病毒。因为成吉思汗的遗传标记只传男不传女。丽贝卡的上司纳兹想要解雇布莱恩，但是丽贝卡说服她让布莱恩留下来和自己一起工作，而不是被关在档案室里。