被沈若寒自我牺牲而救下的杨明远，因自责和害怕不敢向秦川承认自己的身份。但是秦川对党的忠诚，还有价值观感化了杨明远，杨明远决定振作起来，继续投身于革命事业，拯救国家。

秦川带着杨明远博士在郊外逃跑时与地下党碰头，不料这时星野美和也追踪至此，于是又是一场激烈的相互搏火。但是由于武器和人数上的劣势，秦川为了让杨明远等人能顺利逃脱，把敌军注意力都引到自己身上，当他把枪里的子弹打完后，便以淡然自若的姿态弃械投降。

这时，叶琳琳委托顾明杰查梅机关的细菌武器实验室所在地，也有了回复。叶琳琳按照地点，前往该处，打算为夏岚母子偷青霉素解毒，当是为秦川帮上一点忙。在潜入藏有青霉素室，见日军的细菌武器研发专家菊田博士在实验室里面。叶琳琳要挟菊田给她拿出青霉素，而菊田就范后，趁叶琳琳不为意的时候，按响了警报，日军听见警报后，便往实验室冲去。叶琳琳拿走青霉素，杀死了菊田博士之后逃跑。

星野美和见菊田博士被杀死，日军的细菌战可能受到影响，于是气上心头。秦川被星野美和捉到实验室，星野美和为了气秦川，故意在秦川面前打破青霉素，并威胁秦川，要他帮忙污染水源，然病菌扩散。秦川见青霉素被美和越扔越少，于是心生一计，假装妥协，这时，秦川趁军日为他松绑时，以敏捷的身手，抽起敌人腰间的刀，连带杀死两人。美和拔枪，与秦川在实验室进行一场恶战，但是最后以身手和智慧，还是秦川更胜一筹，于是毒妇星野美和如愿死在秦川手下。这时梅机关的手下闻声赶来，也被秦川杀死。

秦川虽然逃脱，但是青霉素已毁，正当秦川绝望的时候，叶琳琳带着一批青霉素，交给了秦川。叶琳琳向秦川坦露自己心迹，让秦川好好爱家人，并祝福秦川，最后留下一封信给秦川，便不辞而别。

秦川带着青霉素回到家里，但是青霉素的剂量只够一个人使用。

两天后，阿灿因受到适当的治疗，回复健康，但是夏岚为了阿灿，把青霉素的剂量都给了自己儿子，正危在旦夕。这时，传来了日本投降的喜讯，在这段让人喜悦的消息中，夏岚释然地离开这个世界。秦川悲喜交集，拥住身体还温热的妻子，在丧妻的悲伤中，迎接了新中国的美好篇章。（大结局）