里瑟跟踪着“号码”孔——一名国际商人，他本应该坐飞机到伦敦，却在中途因身体不适来到了急诊室，医生诊断孔得了流感并给他注射抗病毒剂治疗他的病情。弗  斯科前往安全屋找卡尔寻求调查线索。孔在注射抗病毒剂后，死在了急诊室，医生们采取了紧急隔离措施，芬奇也赶来帮忙。

孔的血检结果显示他来急诊室前就已经感染了禽流感，在医生给他注射活性人流感病毒后两种病毒融合产生了一种高致命高传染性的新病毒！根通过调查发现给孔注射的那批抗病毒剂在运输的途中被更改线路运送到了一间实验室，显然是有人制造了这起疫情。根让“机器”分析了孔的血样，在运行了五万亿次后才模拟出杀死孔的那种病毒的染色体，而能拥有同样计  算能力的只有一位——“撒马利亚人”。

最后“机器”分析出了治疗疫情的抗体药剂阻止了病毒的蔓延，但疫情过后，疾病控制及预防中心建议所有人接受体检以便  政府确定谁需要注射疫苗，然而这一切都是“撒马利亚人”为了采集人们DNA的行为，一场阴谋似乎正在酝酿着…