美里被晋升为三佐，剑介他们特意搞了聚会庆祝。这时，在卫星轨道上出现了迄今为之最大的一个使徒，它的本体，在探测到NERV的位置后照准加速坠落下来。在源堂不在的情况下，美里制订了用EVA三机共同利用A·T·FIELD抵挡的计划并取得成功。为此，源堂从南极发回了贺电，真嗣也因此找到了“ 乘坐EVA战斗的理由”。好不容易打赢了第九使徒，美里本来说要带三个小孩吃大餐，可惜天性懒散的她没钱了，最后被拖去吃路边摊拉面……